5月25日出版的《自然》增刊“2017中國自然指數”顯示，2012年以來，隨著自然指數（Nature Index）追蹤的中國論文總量的不斷增加，其中涉及國際合著者的論文比例也在逐年上升，2016年已超過該指數所追蹤的中國論文總量的50%。
2016年，中國科學院高能物理研究所與意大利國家核物理研究院形成該指數中最主要的中外雙邊合作關系，北京大學與哈佛大學的合作緊隨其后。在前十大中外雙邊合作關系中，德國馬普學會參與了其中五個。
但是，中國國內機構間的合作深度仍遠高于國際合作。在該指數中，前56組國內機構間合作的分值都高于排列第一的中外機構合作分值。
在國內城市間的合作方面，北京的科研機構對自然指數的貢獻最大，而且去年與其他國內機構的合作也最多。位于其后的是上海和南京。但在這些大都市之外，規模次之的一些城市的科研機構也憑借自己的專長，成為實力雄厚的合作者。
例如，昆明因其獨一無二的生物多樣性，一直是植物和生態學專家們的科研福地；地處東北的長春則以悠久的化學研究而著稱。2016年，昆明的科研機構與中國其它科研機構有190組科研合作，并有合著論文被納入自然指數，在自然指數覆蓋的184個中國城市中位列第16位。昆明被納入自然指數的論文中有三分之二以上來自化學領域，其中許多論文研究的是植物的化學結構和過程。去年長春最主要的科研合作關系，是中國科學院長春應用化學研究所與位于北京的中國科學院大學的合作。
該增刊在自然指數所追蹤的68本期刊之外，還首次從規模更大的數據庫，即Clarivate Analytics（科睿唯安）的Web of Science數據庫，來觀察中國的科研表現。“這有助于我們的讀者和指數用戶從整體上，以及一些特定的學科領域，全面了解中國的科研產出情況。通過對比，他們會發現一些有趣的事實，從而更好地理解相關趨勢。”自然指數創始人David Swinbanks說。
如自然指數所顯示的，涉及國際合作的論文占中國高質量科研的很大一部分，但這種國際合作程度并沒有擴展到來自中國的所有論文。在納入Web of Science數據庫的中國論文中，涉及國際合著者的論文比例仍不足25%。“這一較低的國際合作增長率，是由于中國整體的科研產出有大量增加。”科睿唯安中國首席科學家岳衛平博士說。“這可能歸因于語言障礙和機構資源分配的因素。頂尖大學的科研人員往往有更多的機會或資源與國際同行展開合作。”不過，有跡象表明，未來十年，中國整體的國際合作率將會增加，這是因為中國政府為提升中國科研的全球影響力推出了各項政策，如“雙一流”建設，以及旨在促進合作的豐厚資助計劃。
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