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香港理工研發(fā)大數(shù)據(jù)分析平臺揭示癌癥基因關(guān)系

時間:2015-06-24來1源:新華網(wǎng) 作者:謝希語

新華網(wǎng)香港6月23日電(記者謝希語)記者23日從香港理工大學(xué)獲悉,該校癌癥基因組的大數(shù)據(jù)分析取得重大突破,通過建立一個創(chuàng)新的大數(shù)據(jù)分析平臺,分析基因之間的相互作用,揭示在癌癥中基因網(wǎng)絡(luò)的失控機制。

這項突破是理大醫(yī)療科技及資訊學(xué)系講座講授翁一鳴、陳穎志和黃思銓聯(lián)同哈佛大學(xué)生物統(tǒng)計學(xué)專家所組成的研究團隊所取得的成果。

研究團隊還發(fā)現(xiàn)診斷及治療慢性骨髓細胞白血病的潛在標靶基因——核磷蛋白(NPM1)及其相關(guān)基因。有關(guān)研究發(fā)現(xiàn)有助確立由核磷蛋白導(dǎo)向的治療策略,使標靶治療更準確針對問題在所、對癥下藥,同時此分析平臺亦可廣泛應(yīng)用于其他疾病之上。

據(jù)介紹,傳統(tǒng)的癌癥基因研究方法是比較癌癥患者與健康人士的整個基因組,找出有顯著差異表現(xiàn)的個別基因。這種沿用多時的方法并不能找出基因相互作用及其系統(tǒng)性變化,進而了解有關(guān)構(gòu)成癌癥的發(fā)病機制。

在該項研究中,研究團隊假設(shè)參與相同機制的基因會呈共同表現(xiàn)(即基因之間的表現(xiàn)水平互為關(guān)連),并且探討每對基因之間的關(guān)系,從而破解癌癥背后的機制;?qū)M合數(shù)目會隨基因數(shù)目以幾何級數(shù)增加,而人類基因組有超過兩萬個蛋白質(zhì)編碼基因,因此基因共同表現(xiàn)的分析涉及約兩億對基因。

哈佛大學(xué)的生物統(tǒng)計學(xué)專家?guī)椭芯繄F隊進行了大型計算機模擬試驗,確立了癌癥基因共同表現(xiàn)的統(tǒng)計方法。研究團隊克服了處理大量數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn),只需兩天時間便可分析出兩億個基因?qū)Φ墓餐憩F(xiàn),突破傳統(tǒng)方法的不可能,建立了前所未有的科學(xué)基礎(chǔ)。

這項研究確立了一個創(chuàng)新的結(jié)構(gòu)性基因共同表現(xiàn)分析平臺,揭示癌癥發(fā)病機理,并發(fā)展以核磷蛋白導(dǎo)向的治療策略。共同表現(xiàn)分析發(fā)現(xiàn)了基因網(wǎng)絡(luò)上的失控機制,加深對癌癥生物學(xué)的了解,有助確定治療的新方向。這個平臺不但對科學(xué)發(fā)展有所貢獻,并可隨時應(yīng)用于其他疾病的診斷、預(yù)后和治療研究之上。(原標題:香港理工大學(xué)研發(fā)大數(shù)據(jù)分析平臺揭示癌癥基因關(guān)系)

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