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南通大學研究人員受訪談“NgAgo”新文章

時間:2016-11-15來1源:未知 作者:91boshi

  “我們采用NgAgo技術,并不是要進行重復或驗證,僅僅是把它當作一種工具,建立基因敲除斑馬魚模型。”

11月13日,記者聯系到南通大學神經再生重點實驗室副教授劉東,他電話另一端強調著這句話。

在11日出版的新一期《自然》雜志子刊《細胞研究》上,劉東以通訊作者身份發表論文,報告了將NgAgo基因技術用于斑馬魚的研究結果。當天晚上,消息就傳遍國內各大學術圈。“第二天早上起來一看,我的手機都快被各種消息擠爆了。”

一篇論文為何引起這么大的反響?圈內人士告訴記者,雖然是發表在《自然》雜志子刊上,但這樣的轟動效應還是從來沒有過的,原因只有一個,劉東采用了廣受學術界質疑的NgAgo基因技術。這是自韓春雨之后,中國研究人員發表的有關NgAgo基因技術的第二篇學術論文。

今年5月,河北科技大學韓春雨團隊在《自然》雜志子刊《自然·生物技術》上首次發表關于NgAgo基因技術的論文,全球為之轟動。但隨后,多名國內外學者公開表示無法重復論文中描述的實驗,從而引發爭議。

“各路媒體,甚至還有許多國外雜志找到我,讓我發表對韓春雨和NgAgo技術的評價,這真是讓我們很苦惱的問題。”劉東說,客觀地來看,從學術角度確實無法評價,“我們用不同的系統,也沒有重復他的實驗,僅僅是都用了NgAgo這樣一個蛋白質而已,無法做任何關聯和討論”。

劉東告訴科技日報記者,他主要從事的是血管新生方面的研究,“利用多種遺傳操作技術建立轉基因和基因敲除斑馬魚模型”在實驗室主頁關于他本人的研究領域介紹中排第三,也就是說,這只是他的一項“副業”——利用這些模型來研究血管新生。

在此次發表的論文中,劉東敲低的基因是fabp11a,并因此導致斑馬魚眼部發育缺陷。“這與血管新生沒有直接的聯系。”他直截了當地告訴記者。

但是在實驗之初,劉東確實是想利用NgAgo技術進行基因敲除,而不是敲低。敲除和敲低盡管只有一字之差,但卻是完全不同的兩個學術概念。

基因敲除是去除不想要的基因,使目標基因永久性地表達沉默;而基因敲低則保留目標基因,只是阻斷目標基因的表達,但在下一代生物體內依然能夠進行基因表達。敲除是基因編輯的功能之一,而敲低不是。

在5月開始的實驗中,劉東想要完成的基因敲除沒有實現,但是卻意外收獲基因敲低這一結果。為了確保實驗結果的準確性,整個實驗持續了5個多月,直到投稿時實驗仍然在持續。

他們發現,NgAgo的存在,使30%的斑馬魚胚胎在發育后出現了眼部畸形,但這不是基因編輯的結果。測序發現,fabp11a的基因沒有發生任何變化,反倒是fabp11a mRNA的相對表達量下降了約50%。fabp11a沒有被編輯,但被敲低了。

NgAgo對fabp11a mRNA表達的下調只是一個意外嗎?為了驗證這一點,研究人員又對斑馬魚中的其它4個基因進行了測試。結果發現,NgAgo都能實現敲低作用。因此,他們得出結論:NgAgo的敲低作用是具有普遍性的。

“從實驗中看,NgAgo的基因敲低效率(比傳統方法)更高。”劉東說,不過他也補充說,這一觀點并不是很嚴謹,畢竟測試的基因數量很少,方法也不是很系統。

盡管如此,劉東還是很肯定地表示,沒有在NgAgo中重復出基因編輯功能。“我們認為gDNA/NgAgo為斑馬魚中的基因敲低提供了一種替代方案。”在論文中,劉東和他的伙伴們這樣寫道。

對于未來會不會繼續在實驗中研究觀察NgAgo技術,劉東說:“這不是我的主要研究方向和興趣,是否進一步研究還不確定。”(科技日報南京11月13日電)

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